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威尼德分子杂交仪:Western blot常见试验问题归纳与总结 威尼德生物科技(北京),研发生产的经济型分子杂交仪VH-1000、 多功能型分子杂交仪VH-4000、组合型分子杂交仪VH-2000,底部标配培养皿圆 周运动托盘,选配250ML/500ML锥形瓶托盘,96孔酶标板托盘,可适用于如 放置杂交袋等其他严格要求的孵育实验一以及膜洗脱和凝胶脱色,同时可以做 恒温微生物培养。分子杂交仪是现代实验室采用杂交技术的理想设备,可替代塑 料杂交袋和水浴摇床,并防止破损带来的污染危害。 QI: PVDF膜和硝酸膜结合蛋白的原理是什么? A1:一般而言,硝酸纤维素膜是通过疏水作用来和蛋白质相联,假设反复洗几次后, 蛋白容易掉下来,效果较差。尼龙膜主要通过它膜上的正电荷和蛋白接合(注: 常用的PVDF膜即带正电荷的尼龙膜),同时也有疏水作用,但相对较弱。这样 的话,PVDF膜和蛋白接合较牢,不易脱落,效果较好。 Q2:做组织样品的western blot的时候,处理样品有什么诀窍? A2:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋 白需用更剧烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一 点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋 白酶抑制剂),封闭剂一般5%脱脂奶粉。如果一抗为多克隆抗体,使用BSA也 是不错的选择Q3:免疫组化和 Western blot可以用同一种抗体吗? A3:免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表 位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响,天然蛋白和煮 后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失。如果 你所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位,那么这种抗 体可同时用于免疫组化和Western blotting,而如果抗体识别构象形表位,那么只能 用于免疫组化。一般抗体说明书上都有注明此种抗体识别的氨基酸区间。(限于 单抗) Q4:不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上,转移效率低怎么样解决? A4:可以考虑:转移缓冲液中加入20%甲醇(是指终浓度)(优化的转移缓冲液, 可以参考《蛋白质技术手册》),因为甲醇可降低蛋白质洗脱效率,但可增加蛋 白质和NC膜的结合能力,甲醇可以防止凝胶变形,甲醇对高分子量蛋白质可延 长转移时间;转移缓冲液加入终浓度0.l%SDS,也是为了增加转移效率;用优 质的转移膜,或使用小孔径的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交联;低浓度胶, 如低至6%。太大时还可以考虑用琼脂糖胶;提高转移电压/电流;增加转移时 间。 威尼德生物科技(北京),研发生产的经济型分子杂交仪VH-1000、 多功能型分子杂交仪VH-4000、组合型分子杂交仪VH-2000,底部标配培养皿圆 周运动托盘,选配250ML/500ML锥形瓶托盘,96孔酶标板托盘,可适用于如 放置杂交袋等其他严格要求的孵育实验一以及膜洗脱和凝胶脱色,同时可以做 恒温微生物培养。分子杂交仪是现代实验室采用杂交技术的理想设备,可替代塑 料杂交袋和水浴摇床,并防止破损带来的污染危害。 Q5:Western blot哪种染色好? A5:(l)阴离子染料是最常用的,特别是氨基黑,脱色快,背景低检测极限可达 到1.5解,考马斯亮蓝虽然与氨基黑有相同的灵敏度,但脱色慢,背景高。丽春 红S和快绿在检测后容易从蛋白质中除去,以便进行随后的氨基酸分析。缺点是: 溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的皱缩或破坏,不能用于带正电荷的膜。灵 敏度低。 (2)胶体金,灵敏度高,检测范围可到pg级,但染色比拟稳定。 (3)生物素化灵敏度位于1、2之间,可用于任何一种膜。 。6:用Western检测基因转染后细胞培养上清中表达的目的蛋白(定性), 分子量为20KD,浓度约为几百iiRml。蛋白样品是否需浓缩、纯化?如何浓缩、 纯化上清液中的目的蛋白?对小分子蛋白Western blot时需特别注意哪些条件? A6:按照提供的浓度,如果做Western blot,是不用浓缩样品的.对于20kd的小 分子的蛋白,Western Blot中要注意的是: 转移时的时间,转移时的电流或电压. transfer buffer 中加 20%的甲醇. 可以用13-15%的别离胶. Q7:半干法转移与胶的面积和蛋白分子两大小有一定关系、那么湿法转移 是不是所有的转移条件都一样呢? 一般的条件是怎样的? A7:半干转的电流大小是按照面积来算的,时间是根据蛋白分子大小定的;而 湿转的话电流是恒定的,时间也是根据分子量而定。 Q8:采用生物素标记的二抗.SABCDAB检测系统做western,非特异性的条带和背景很高,总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比拟清楚,条带也 很窄,可是越靠下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起,这是什么原因, 如何解决? SDS—PAGE的时候恒压和恒流哪个好? A8:非特异性的条带和背景高:可能性很多,如一抗,二抗,封闭的原因都可 能。总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比拟清楚,条带也很窄,可是越靠 下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起,这种现象是正常的。另外,也可能 积层胶有问题。SDS—PAGE的时候,恒压和恒流都可以用。 威尼德生物科技(北京),研发生产的经济型分子杂交仪VH-1000、 多功能型分子杂交仪VH-4000、组合型分子杂交仪VH-2000,底部标配培养皿圆 周运动托盘,选配250ML/500ML锥形瓶托盘,96孔酶标板托盘,可适用于如 放置杂交袋等其他严格要求的孵育实验一以及膜洗脱和凝胶脱色,同时可以做 恒温微生物培养。分子杂交仪是现代实验室采用杂交技术的理想设备,可替代塑 料杂交袋和水浴摇床,并防止破损带来的污染危害。 VH-2000 VH-2000 -、 g △ 。9:血清样品进行 Western blot分析,目的蛋白21kD,结果显色出来后, 目的条带很淡,而白蛋白和及G条带很浓,为什么? A9:可能是因为白蛋白为67kD和目的蛋白相差较大,且其浓度较低,可以底物二氨基联苯胺和0.01%过氧化氢溶液显色的时间延长为30分钟,再用去离子水 漂洗以终止反响;也可能是抗体的特异性不好。把封闭的时间延长,同时提高封 闭液的浓度,可以减少以下背景噪音。同时洗的时候要彻底,而目的条带弱,说 明浓度缺乏,如果不考虑后续功能的线 (细)柱子,纯化靶蛋白, 接着真空冷冻浓缩,可以得到很好的结果。 Western转膜已经成功了,但是Marker泳道未见蛋白条带,其余各泳道均有清晰的蛋白条带,经考马斯亮蓝染胶,结果相同。经5%的脱脂牛奶封闭 1小时45分钟后,进行一抗孵育(1: 200,建议起始浓度)过夜,二抗孵育5个半小时(1:2000),均在室温下,DAB显色,虽出现蛋白条带,但较弱,且出
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